据了解，野生扬子鳄种群的雌雄比例约为5：1，与扬子鳄亲缘关系较近的美国密河鳄野生种群的雌雄比例也为5：1。这样的性别比是怎么出现的呢？安徽省扬子鳄繁育研究中心副主任王朝林道出了其中的谜团：“扬子鳄并不是靠染色体决定后代性别的，后代的性别是由孵化时的温度所决定。”

    据了解，野生扬子鳄出没于长江中下游地区，孵化期在每年的7月至9月初之间，此时正值长江中下游地区的高温期，同时雨水也较多，巢穴受雨淋和地表水的影响，含水量高，因此鳄卵一般是在高温、高湿的条件下孵化的，巢穴孵化温度一般为27摄氏度至34．5摄氏度。

    当扬子鳄卵在孵化温度为28．5摄氏度时，孵出的全部为雌鳄；当气温在33．5摄氏度到35摄氏度时，孵出的全为雄鳄；气温在30摄氏度时，雌雄比例相等。也就是说，温度越高，孵化出的雄性幼鳄越多。

    野外扬子鳄的巢穴，大部分筑于山凹浓荫潮湿之处，小部分建在向阳北坡或南坡，或水边草丛中。这些建于不同环境的窝巢，温度可相差几摄氏度。山凹浓荫潮湿处的窝巢温度较低，因而能产生较多的雌鳄，而野生扬子鳄的栖息地一般都会选择在山凹中。专家们认为，野生扬子鳄雌多雄少，这也许是扬子鳄为适应环境的不断恶化所做出的不得已的选择。